显微镜的基本构造由两部分组成:机械部分和光学部分。 
机械部分的功能是将光学具组各部件固定在保证成像光路的*位置上，并且可以调节聚焦提供物像的*清晰度.光学显微镜的机械部件的基本构型已在19世纪80年代完成定型。目前出售的小型生物研究显微镜几乎保持着19世纪80年代蔡司显微镜的原型。 
这类显微镜由镜筒、物镜转换器、镜臂、镜脚、载物台、粗动调焦螺旋、微动调焦螺旋、聚光镜支架、聚光镜调节螺旋、孔径光栏等所组成。其镜简、目镜、物镜转换器载物台、聚光镜系统全部悬挂在镜壁上。因此，调焦螺旋、聚光器调节螺旋等所有光路调节系统只与镜臂相关联.镜脚只有一项单一功能即用以使显微镜稳定地站立在实验台上.镜臂与镜脚之间连以倾斜关节，以此迎合光源射来的方向. 
这类显微镜的调焦方式是靠调焦螺旋提升或下降镜筒以改变物镜与固定不动的载物台之间的距离来实现。 
现代数码显微镜的机械部件和机械布局有了很大变化.各个生产显微镜的大厂家正在使自己的各种类型的光学显微镜系列化，正在生产适用于各种显微镜的标准化主机。这种主机上可以根据用户的使用现代光学显微镜的机械部件和机械布局有了很大变化。各个生产显微镜的大厂家正在使自己的各种类型的光学显微镜系列化，正在生产适用于各种显微镜的标准化主机。这类主机与传统显微镜迥然不同。首先其镜脚已改为巨型镜座。镜座由单一支架功能演变为多功能的机台。光源系统、滤光系统、调焦系统以及聚光系统，甚至一些光路转换装置，光栏系统均被安装在镜座上。镜臂与镜座之间已变为一体化机件，调焦动作已不能靠镜臂的升降来实现，而是靠载物台的升降。这种镜体的功能也愈来愈复杂.功能也愈来愈多。镜体上安装复杂的镜筒头、各类照像机、摄像机、电视发生器、光电倍增器以及落射光系统的联接口。这类显徽镜的调焦螺旋和载物台移动螺旋分别实现了同轴化。所有这些变化顺应着光学显微镜发展的一种的趋势即积木化和集成化的趋势。