为了获得单一类型微生物，即纯培养物，微生物学家通常采用称作富集培养的技术。

为了富集，首先要选择好适合对象微生物的培养基，称为选择性培养基。例如，当我们想分离有固氮作用的细菌时，在培养基中可以加糖，但不能用含氮的营养物。又如培养厌氧菌时要隔绝氧气，而好氧菌则要保证通气。此外，某些特定微生物需要特殊的营养物，例如许多致病菌必须在培养基中加入血清，有些微生物又需要特定的维生素。还有细菌、放线菌的生长繁殖一般要求偏碱（7.0～7.5），霉菌和酵母菌要求偏酸（4.5～6） ；分离放线菌时，在培养基中加入数滴10％的苯酚，可以抑制霉菌和细菌的生长；在分离酵母菌和霉菌的培养基中，添加青霉素、四环素和链霉素等抗生素可以抑制细菌和放线菌的生长；结晶紫可以抑制革兰氏阳性菌，培养基中加入结晶紫后，能选择性地培养G－ 菌；7.5％NaCl可以抑制大多数细菌，但不抑制葡萄球菌，从而选择培养葡萄球菌；德巴利酵母属中的许多种酵母菌和酱油中的酵母菌能耐高浓度（18％～20％）的食盐，而其他酵母菌只能耐受3％～11％浓度的食盐，所以，在培养基中加入15％～20％浓度的食盐，即构成耐食盐酵母菌的选择性培养基。因此微生物培养基种类很多，有酵母霉菌青霉曲霉培养基，细菌数大肠菌群粪大肠菌群大肠杆菌培养基，金黄色葡萄球菌检验系列培养基，沙门氏菌，志贺氏菌检验系列培养基等。

  常用的细菌培养基有营养肉汤和营养琼脂培养基；常用的放线菌培养基为高氏1号培养基；常用的酵母菌培养基有马铃薯蔗糖培养基和麦芽汁培养基；常用的霉菌培养基有马铃薯蔗糖培养基、豆芽汁葡萄糖（或蔗糖）琼脂培养基和察氏培养基等。